课题组左元礼、刘文荣等在Bioinformatics Advances发表了研究论文

2024年8月16日，课题组左元礼、刘文荣等在生物信息学期刊Bioinformatics Advances发表了环状RNA数据库C2CDB。开发了一个名为 CircRNA to Cancer Database （C2CDB） 的综合平台，集成了癌症相关 circRNAs 的综合信息和分析工具，包括 30 种癌症在肿瘤和邻近组织中表达的 318 158 个癌症相关 circRNA。C2CDB 提供基本细节，例如 circRNA 的序列和表达水平，以及对生物学机制的重要见解，包括 miRNA 结合、RNA 结合蛋白相互作用、编码电位、碱基修饰、突变和二级结构。此外，C2CDB 收集了有关癌症 circRNAs 的已发表文献的广泛汇编，提取并呈现了这些研究中包括生物学功能、潜在机制和分子工具的关键内容。此外，C2CDB 提供了分析三种潜在机制的集成工具：circRNA-miRNA ceRNA 相互作用、circRNA 编码和 circRNA 生物发生，有助于研究人员方便地获取高度可靠的信息。为了提高清晰度和组织性，C2CDB 精心策划和整合了以前混乱的 circRNA 命名法，解决了围绕其名称的普遍混淆和歧义。 C2CDB 可在 http://pengyonglab.com/c2cdb 免费获得。